Сюжет драматического сериала «Хороший доктор» вертится вокруг молодого парня Шона Мёрфи, обладающего выдающимися способностями. Он родился и вырос в небольшом городке, а его детство было отнюдь не счастливым. Будучи больным синдромом саванна и легкой формой аутизма Шон отличается от остальных людей. Он испытывает трудности в общении, трудности с вербальными навыками и абстрактными понятиями, но это не помешало Шону получить работу в хирургическом отделении больницы Сан-Хосе, а также стать блестящим хирургом-ординатором, чей незаурядный ум и гениальные способности помогают спасать человеческие жизни.