Повествование комедийного мультфильма «Босс-молокосос» ведется от имени мальчика Тима Темплтона, который начал подозревать, что его младший брат не тот за кого себя выдает. Долгие семь лет Тим был счастлив жизнью с любящими, заботливыми родителями, которые в нем души не чаяли, но с появлением младшего брата все очень сильно изменилось. Младенец оказывается не просто милым малышом, а настоящим расчетливым и жестким лидером, который носит костюм и портфель, что уже очень странно. Но родители совершенно не замечают никаких странностей, так как босс-молокосос подчинил их себе. Родители думают, что фантазер Тим все выдумывает из-за банальной ревности. Однако вскоре догадки мальчика подтверждаются: молокосос вовсе не тот, кем хочет казаться. К тому же Тим узнает о предстоящем крупном заговоре, а чтобы его остановить, он вынужден объединить усилия со своим младшим братом.